醫(yī)藥制造業(yè)的稅收征管，應(yīng)根據(jù)其行業(yè)特點，以信息化為依托，全面及時掌握企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營、財務(wù)核算和資金流轉(zhuǎn)信息，以物流、資金流控制為重點，對企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營的事前、事中、事后的全過程進行監(jiān)控，最大限度減少稅款流失。

一、稅收征管重點

根據(jù)藥品生產(chǎn)行業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營的主要特點，對醫(yī)藥制造企業(yè)的稅收管理應(yīng)當重點抓好以下幾個環(huán)節(jié)：

（一）原材料管理環(huán)節(jié)

加強對企業(yè)原材料采購、入庫、領(lǐng)用等環(huán)節(jié)的監(jiān)控，防止出現(xiàn)涉稅風險。比如有些原料保管不當，極易造成霉變報廢，如企業(yè)不按規(guī)定進行稅務(wù)處理，容易造成稅收流失。

（二）藥品生產(chǎn)環(huán)節(jié)

加強對企業(yè)成本結(jié)轉(zhuǎn)的監(jiān)控，防止出現(xiàn)虛增或轉(zhuǎn)嫁成本從而造成稅款流失的問題。比如有的企業(yè)可能會將應(yīng)當作報廢處理的原材料作領(lǐng)料處理，從而虛增生產(chǎn)成本；有的企業(yè)還可能會隱瞞藥品產(chǎn)成品數(shù)量，從而增加入庫產(chǎn)品的單位成本。

（三）藥品儲運環(huán)節(jié)

加強產(chǎn)品出入庫的管理，醫(yī)藥制造企業(yè)一般都存在內(nèi)部人員自用藥品和將庫存藥品贈送他人的行為，還會出現(xiàn)庫存或銷售退回藥品過期報廢現(xiàn)象，企業(yè)可能不做、少做視同銷售和非正常損失的稅務(wù)處理。

（四）藥品銷售環(huán)節(jié)

重點關(guān)注企業(yè)銷售模式，分析企業(yè)產(chǎn)品定價區(qū)域差異是否在合理范圍，會務(wù)費、廣宣費等有無違規(guī)列支問題，以及醫(yī)藥制造企業(yè)有無將藥品低價銷售給關(guān)聯(lián)企業(yè)從而進行惡意稅收籌劃問題。

二、稅收征管難點

醫(yī)藥制造企業(yè)的稅收征管存在以下難點：

（一）藥品成本監(jiān)控難

由于藥品品種多、規(guī)格多，因涉及商業(yè)秘密，不愿主動向稅務(wù)機關(guān)提供藥品配方，稅務(wù)機關(guān)難以掌握其原料投入、成本歸集等情況，很難監(jiān)控納稅人藥品生產(chǎn)的真實成本。

（二）銷售價格監(jiān)控難

納稅人生產(chǎn)銷售品種多，價格結(jié)算比較復(fù)雜，雖國家規(guī)定對藥品價格實行政府定價、政府指導價或者市場調(diào)節(jié)價的價格管理辦法，但納稅人通常根據(jù)經(jīng)營的需要，在不違反國家法律的前提下，制定了各自的價格結(jié)算辦法，加上“以藥養(yǎng)醫(yī)”、企業(yè)間不正當競爭等因素，造成藥品價格高開現(xiàn)象大量存在，給稅務(wù)機關(guān)監(jiān)控藥品真實銷售價格帶來困難。

（三）銷售數(shù)量核實難

由于納稅人的營銷模式特殊，賒銷和代銷情況較多，稅務(wù)機關(guān)難以監(jiān)控貨物是否已發(fā)出，難以判定是否已經(jīng)實現(xiàn)銷售，難以掌握真實銷售數(shù)量。

（四）稅前扣除核實難

醫(yī)藥制造業(yè)是知識密集和資金密集型行業(yè)，前期生產(chǎn)準備投入較大，且藥品可替代性強，市場競爭激烈，企業(yè)為生存、發(fā)展需要，研發(fā)投入和市場投入費用較多，給稅務(wù)機關(guān)對費用的歸集、劃分及其真實性、相關(guān)性、合理性的核實帶來較大困難。

（五）涉農(nóng)產(chǎn)品進項稅額核實難

中藥、中成藥和生物制品等產(chǎn)品的加工生產(chǎn)都涉及到農(nóng)產(chǎn)品的采購，由于增值稅政策中對農(nóng)產(chǎn)品抵扣的特殊規(guī)定，使稅務(wù)機關(guān)對增值稅進項稅額核實較難。

（六）關(guān)聯(lián)交易監(jiān)控難

部分納稅人利用關(guān)聯(lián)方之間的購銷商品、轉(zhuǎn)讓有形或無形資產(chǎn)、出讓與受讓股權(quán)、提供擔保等方式，通過稅負差、地區(qū)稅收優(yōu)惠差異等達到減少企業(yè)或者其關(guān)聯(lián)方應(yīng)稅所得的目的，增加了稅收征管的難度。